Staphylocoque doré. C’est l’une des bactéries le plus souvent rencontrées dans les hôpitaux. (USDA)

Le staphylocoque doré est l’une des bactéries pathogènes le plus fréquemment rencontrées en milieu hospitalier. Ses infections peuvent être mortelles, d’autant plus si la souche est résistante aux antibiotiques. Plutôt que de vouloir tuer ce microbe, ou de l’empêcher de se reproduire, une équipe franco-suisse, emmenée par Patrice François, bactériologiste aux Hôpitaux universitaires de Genève (HUG), cherche à en juguler la virulence. Les chercheurs espèrent jouer sur de petites molécules, appelées ARNs régulateurs, qui sont émises lors de l’activation du pathogène. Ils en ont recensé plus d’une centaine, nombre dépassant de loin ce qui était connu jusque-là pour le staphylocoque doré. Leurs travaux viennent d’être publiés dans la revue Plos One.

Une coque blindée avec, à l’intérieur, un chromosome unique accompagné de nombreux ribosomes, ces «machines à décoder» le patrimoine génétique: voilà le portrait-robot d’une bactérie. Pour assurer ses diverses fonctions vitales (respiration, digestion, reproduction…), celle-ci synthétise de nombreuses protéines. Elles sont obtenues comme ailleurs dans le vivant grâce à un ballet moléculaire incessant: l’information génétique codée dans l’ADN du chromosome est copiée sous une autre forme d’instruction génétique, l’ARN messager, qui est amenée à l’usine ribosomiale.

Machinerie cellulaire

Mais la machinerie cellulaire est plus complexe que cela. Avec le développement conjoint d’outils d’analyse moléculaire et de la bio-informatique, les biologistes se sont aperçus que certaines parties non codantes de l’ADN, c’est-à-dire situées entre deux gènes, étaient tout de même transcrites sous la forme de petites molécules agissant comme facteurs de régulation de l’organisme vivant. Le premier ARN régulateur du staphylocoque doré, l’ARN III, a ainsi été découvert en 1988. Et son rôle explicité dix ans plus tard.

«Les bactéries sont équipées d’un système sensoriel assez extraordinaire qui leur permet de sentir les modifications de leur environnement immédiat et de s’y adapter, explique Jacques Schrenzel, médecin responsable du laboratoire de bactériologie des HUG. Lorsqu’elles sont assez nombreuses, un signal moléculaire implique la fabrication de l’ARN III. Celui-ci active ensuite des gènes producteurs de toxines puissantes et diminue l’expression des gènes responsables de l’adhésion aux cellules.» L’infection est engagée. Les bactéries n’adhèrent plus ensemble et peuvent diffuser dans l’organisme hôte pour l’intoxiquer.

Semblables à des chefs d’orchestre, ces petits bouts d’ARN décident de l’intervention ou non des instruments de musique du corps que sont les gènes. Leur intérêt en tant que cibles thérapeutiques est donc évident. Des méthodes prédictives avaient permis de recenser à ce jour une vingtaine de ces régulateurs pour le staphylocoque doré. Pour Patrice François, la démarche doit être exhaustive afin d’identifier les ARN indispensables à l’expression de la virulence bactérienne. C’est ce que le chercheur a fait en analysant l’ensemble des molécules transcrites lors de la croissance d’une souche bactérienne au génome connu.

Quelque 160 ARN candidats potentiels ont été ainsi dénombrés; 25 ont été sélectionnés selon leur position dans le matériel génétique bactérien. Pour juger de l’intérêt de cette sélection, les chercheurs ont soumis la culture microbienne à divers stress (pH, température, présence de sucres ou d’oxydants) mimant les conditions rencontrées dans le corps humain. Le même type d’analyse génomique a été réalisé au début et à la fin de la croissance bactérienne. Résultat: chacun des ARN a vu son expression évoluer à des degrés divers selon le stress appliqué. Une observation qui confirme leur rôle de facteurs de régulation.

«Il y a vingt ans, nous pensions que l’essentiel du fonctionnement cellulaire était écrit dans les gènes, s’exclame François Vandenesch, bactériologiste français responsable du Centre national de référence des staphylocoques. Ces travaux sont un bel exemple montrant qu’il n’en est rien et qu’il y a encore beaucoup à apprendre sur le monde des petits ARN.»

Si cette approche est avant tout fondamentale, peut-elle mener à une alternative aux antibiotiques actuels? L’industrie pharmaceutique ne s’y intéresse pas pour l’instant, préférant concentrer ses efforts sur le développement de vaccins contre le staphylocoque doré. Certains essais thérapeutiques menés sur ces derniers seraient aujourd’hui en phase clinique III, soit la dernière avant leur possible utilisation.

Solutions encouragées

«Toutes les solutions doivent être encouragées, reprend Kathrin Mühlemann, infectiologue à l’Université de Berne. Les vaccins sont la solution préventive la plus intéressante. Mais cela fait maintenant plusieurs années qu’ils sont étudiés, sans résultat probant.» Imaginer un médicament anti-infectieux en jouant sur la virulence de la bactérie est une stratégie intéressante. ­Celle-ci ne passe pas forcément par l’intervention des petits ARNs: des travaux parus dans la revue Science viennent en effet de révéler la découverte de nouvelles petites molécules, appelées aureusimines, constituant un autre facteur de régulation du staphylocoque doré.

«Cette étude suisse est tout à fait dans la lignée de la biologie moderne qui permet d’avoir, grâce à des outils d’analyse puissants, une vision sans a priori du fonctionnement d’un organisme vivant, conclut François Vandenesch. A l’avenir, le séquençage à haut débit pourra vraisemblablement être appliqué de façon plus systématique, pour le suivi de patients par exemple.»

C’est d’ailleurs la prochaine étape que se sont fixée les chercheurs genevois: tester leur méthode sur des échantillons provenant d’humains ou d’animaux infectés et vérifier in vivo leurs premiers résultats.

Source: Caroline Depecker - LeTemps.ch

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Photo non-datée de bactérie Mycoplasmes

La création de la première cellule vivante dotée d’un génome synthétique dévoilée jeudi représente une avancée dans la compréhension des mécanismes de la vie et ouvre la voie à la fabrication d’organismes artificiels pouvant par exemple produire du carburant propre.

« Il s’agit de la création de la première cellule vivante synthétique, au sens où celle-ci est entièrement dérivée d’un chromosome synthétique », explique Craig Venter, créateur de l’Institut du même nom et co-auteur du premier séquençage du génome humain dévoilé en 2000.

« Ce chromosome — élément porteur de l’information génétique contenant un groupe de gènes de l’organisme, ndlr– a été produit à partir de quatre flacons de substances chimiques et d’un synthétiseur, et tout a commencé avec des informations dans un ordinateur », poursuit-il, qualifiant ce succès « d’étape importante scientifiquement et philosophiquement ».

Cette percée « change ma vision de la définition de la vie et de son fonctionnement », ajoute ce chercheur, un des co-auteurs de ces travaux parus dans la revue américaine Science datée du 21 mai.

« Cette approche est en effet un très puissant instrument pour tenter de concevoir ce que nous attendons de la biologie et nous pensons ainsi à une gamme étendue d’applications », précise-t-il.

Craig Venter avait annoncé en 2008 être parvenu avec son équipe à fabriquer un génome bactérien 100% synthétique en collant des séquences d’ADN synthétisées bout à bout afin de reconstituer le génome complet de la bactérie Mycoplasmes genitalium. Ce génome avait ensuite été transplanté dans une autre bactérie, mais sans que celle-ci ne puisse fonctionner.

Pour créer une cellule contrôlée par un génome synthétique, les chercheurs ont repris ces deux techniques élaborées en 2008.

Le génome qu’ils ont fabriqué est la copie d’un génome existant, celui de la bactérie mycoplasme mycoïde, mais avec des séquences d’ADN supplémentaires pour l’en distinguer.

Ils ont ensuite transplanté ce génome synthétique dans une autre bactérie, appelée microplasme capricolum, réussissant à « activer » les cellules de cette dernière.

Malgré le fait que quatorze gènes aient été effacés dans la bactérie receveuse du génome synthétique, celle-ci ressemblait bien à une bactérie microplasme capricolum dont les gènes ne produisaient que ses protéines, précisent les auteurs de ces travaux.

« Si ces techniques peuvent être généralisées, la conception, la synthèse, l’assemblage et la transplantation de chromosomes synthétiques ne seront plus des obstacles aux progrès de la biologie synthétique », écrivent-ils dans un résumé de leur étude.

C’est ainsi que selon Craig Venter, ces chercheurs vont tenter de concevoir des algues capables de capturer le dioxyde de carbone (CO2), principal gaz à effet de serre, et de produire de nouveaux carburants propres.

Des recherches sont aussi en cours notamment pour accélérer la production de vaccins, fabriquer de nouvelles substances chimiques, des ingrédients alimentaires et des bactéries capables de purifier l’eau.

Qualifiant de « boîte de Pandore » ces travaux, Pat Mooney, directeur de l’ETC Group, organisme international privé de surveillance des technologies basé au Canada, estime que « la biologie synthétique est un champ d’activité à haut risque mal compris motivé par la quête du profit ».

« Nous savons que les formes de vie créées en laboratoire peuvent devenir des armes biologiques et menacer aussi la biodiversité naturelle », ajoute-t-il dans un communiqué.

Le Craig Venter Institute a déposé des brevets recouvrant certaines des techniques décrites dans les travaux publiés jeudi.

Source: © 2010 AFP – TV5

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@Agence France-Presse

Cette découverte qui porte à neuf le nombre de gènes impliqués dans cette maladie découverts jusqu’à présent, pourrait au cours des prochaines années ouvrir la voie à de nouveaux traitements pour en retarder l’apparition, la combattre voire la prévenir, précisent les auteurs de l’étude parue dans le Journal of the American Medical Association (JAMA) daté du 12 mai.

«Identifier chacun de ces gènes sur l’ADN, un sur le chromosome 2 – proche d’un gène appelé BIN1 – et le second sur le chromosome 19 – à proximité de plusieurs gènes dont EXOC3L2, BLOC1S3 et MARK4 -, révèle de nouveaux mécanismes biologiques d’Alzheimer», explique le Dr Sudha Seshadri, professeur adjointe de neurologie à la faculté de médecine de l’Université de Boston (Massachusetts, nord-est), un des principaux auteurs de cette recherche.

«Bien que les bienfaits thérapeutiques de cette découverte ne se matérialiseront probablement pas avant une dizaine d’années, l’étude de ces mécanismes devrait déboucher sur de nouveaux moyens de retarder ou d’empêcher la maladie et peut-être de la traiter», ajoute-t-elle.

Ces chercheurs ont recueilli leurs données à partir d’un échantillon de plus de 35 000 personnes aux États-Unis et en Europe, suivies durant plusieurs décennies, dont plus de 8 000 ont développé un Alzheimer.

Source: AFP – Cyberpresse.ca

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Troupeau de Mammouth @DK 2003

Symbole des périodes glaciaires de la préhistoire, le mammouth laineux descend pourtant d’un ancêtre africain, comme les éléphants actuels, apparu il y a 6 à 7 millions d’années. Comment ce mastodonte, qui a migré vers le Nord au moment où l’Arctique se refroidissait, il y a un à deux millions d’années, s’est-il adapté à des températures inférieures à zéro?

En plus de se couvrir de laine et de réduire la taille de ses oreilles, le mammouth a adapté le transport de l’oxygène dans son sang pour qu’il demeure efficace même dans le froid, selon une étude publiée aujourd’hui par la revue Nature Genetics.

Ressuscitée grâce à une bactérie

L’équipe de Kevin Campbell (Université du Manitoba, Canada) et d’Alan Cooper (Université d’Adélaïde, Australie) a réussi à recréer cette protéine du sang à partir de l’ADN d’un mammouth de 43.000 ans, retrouvé il y a plusieurs années dans le permafrost sibérien. Les chercheurs ont isolé les gènes permettant la fabrication de l’hémoglobine chez le mammouth et les ont ensuite insérés chez la bactérie E. coli pour qu’elle produise la protéine. Cette méthode est par exemple utilisée pour produire de l’insuline humaine. L’hémoglobine du mammouth a ensuite été comparée à celle de l’éléphant d’Afrique et de son cousin d’Asie.

Economie d’énergie

Chez l’éléphant actuel, comme chez l’humain, l’apport d’oxygène dans les muscles fonctionne mieux à haute qu’à basse température. En effet l’oxygène se lie avec l’hémoglobine, qui peut ainsi la transporter. Cependant plus la température diminue plus les liens entre la protéine et le gaz se resserrent, réduisant du même coup l’oxygénation des tissus. L’hémoglobine du mammouth laineux diffère de celle des éléphants, expliquent Campbell et ses collègues: elle permet justement de réduire la chaleur nécessaire à la livraison de l’oxygène.

Ainsi les pattes du mammouth pouvaient être bien oxygénées sans avoir besoin d’être réchauffées, suggèrent les chercheurs. Ce système, à l’œuvre chez les rennes arctique, permettait sans doute au mastodonte d’économiser de l’énergie.

Source: Cécile Dumas – sciencesetavenir.fr

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Montréal, 29 avril, 2010 – L’Institut de recherche en immunologie et en cancérologie (IRIC) de l’Université de Montréal est fier d’annoncer le lancement de la toute première unité de recherche en ingénierie des acides ribonucléiques (ARN) au Canada. Dirigée par François Major, chercheur principal en bio-informatique à l’IRIC, avec la collaboration de Gerardo Ferbeyre, chercheur en biochimie à la Faculté de médecine de l’Université de Montréal, l’équipe vise à maîtriser le comportement des ARN, lesquels sont au cœur de la programmation de la cellule, pour ainsi guérir et même prévenir le cancer. La nouvelle unité loge au troisième étage du Pavillon Marcelle-Coutu de l’IRIC.

L’ARN joue un rôle primordial dans la cellule en assurant à la fois l’acheminement et l’exécution des instructions encodées dans le programme de l’ADN. François Major et son équipe testent déjà avec succès des micro-ARN qu’ils fabriquent sur mesure pour bloquer la prolifération de cellules de cancer de la prostate. Ils envisagent aussi un jour fabriquer des ARN capables de détecter les conditions menant au développement de la maladie dès qu’elles se manifestent et de réagir instantanément pour corriger la situation.

« Les résultats que nous obtenons en laboratoire sont très prometteurs en matière de solutions de médecine personnalisée pour traiter le cancer. Nous planifions aussi de mettre au point des micro-ARN capables de protéger la cellule tout comme un logiciel antivirus qui identifie et élimine les attaques avant même que celles-ci ne causent des dommages à l’ordinateur, explique François Major. Ce serait une arme redoutable contre le cancer, n’est-ce-pas ? »

Avec ses nouvelles installations, le Dr Major pourra lui-même rapidement tester sur place, à l’aide de son collègue le Dr Ferbeyre et de son équipe, ses modèles informatiques à partir des données obtenues de leurs expériences. Ils pourront ainsi perfectionner sur le champ ces modèles. L’approche de recherche inusitée qu’il propose, soit l’intégration d’expertises en biochimie, en biologie moléculaire et en informatique in situ, optimisera l’avancement des recherches en cours.

« Il est rare pour un informaticien de diriger ses propres expériences en laboratoire, explique le Dr Guy Sauvageau, chef de la direction et directeur scientifique de l’IRIC. L’informatique sert généralement d’outil ou de moyen pour obtenir des résultats en biologie et non le contraire. Or, les projets de recherche de François Major et l’approche intégrative qu’il propose pour les réaliser sont riches de promesses, ce qui explique l’engouement des instances de financement et de nos partenaires industriels pour la nouvelle unité de recherche en ingénierie des ARN de l’IRIC, une des rares au monde. Le Dr Major est un pionnier dans son domaine et la mise sur pied de cette nouvelle équipe est le tout dernier exemple de son exceptionnel esprit d’innovation. »

Outre les retombées sur les avancées en recherche sur le cancer, la synergie générée par les expertises en informatique et en biochimie intégrées à l’IRIC bénéficiera aussi les étudiants. Ceux-ci auront la chance unique d’exploiter simultanément des techniques de pointe en informatique et en biochimie. Cet apprentissage intégré contribuera à leur compétitivité sur le marché du travail.

Partenaires en recherche :

L’aménagement de l’unité de recherche en ingénierie des ARN de l’IRIC a été rendu possible avec le concours financier de la Fondation canadienne pour l’innovation, le Ministère de l’Éducation, du Loisir et du Sport, les Instituts de recherche en santé du Canada, le Conseil de recherches en sciences naturelles et en génie du Canada, PerkinElmer, IBM, VWR, Fisher Scientific, TekniScience, Montreal Biotech, Nuaire, Nikon, Bio-Rad, Inso et Ultident.

Sur le Web :

Institut de recherche en immunologie et en cancérologie : www.iric.ca
Université de Montréal : www.umontreal.ca

Source: Carolyne Lord – Université de Montréal

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Réparer l’ADN endommagé…

Notre organisme développe de nombreuses stratégies pour protéger et maintenir l’intégrité de son patrimoine génétique. L’action délétère d’agents physiques ou chimiques crée des lésions dans l’ADN et perturbe l’expression des gènes. Si ces lésions ne sont pas prises en charge par des systèmes de réparation performants elles seront à l’origine de mutations conduisant à des cancers et au vieillissement de l’individu. Les travaux menés il y a quelques années par Jean-Marc Egly, Membre de l’Académie des sciences, avaient permis de découvrir (au travers de l’identification du facteur TFIIH) la relation entre le mécanisme de lecture des gènes et celui de la réparation de l’ADN baptisé NER (Nucléotide excision repair) garant du maintien de la stabilité génétique (cf schéma ci dessous).

Grâce à cette découverte, les maladies pour lesquelles l’altération des mécanismes de réparation de l’ADN avait été mise en évidence sont dorénavant mieux connues. C’est le cas de la « maladie des enfants de la lune » ou Xeroderma pigmentosum, maladie génétique rare, qui entraîne une hypersensibilité au soleil et un risque très élevé de cancer de la peau. Des mutations sur onze des gènes impliqués dans les mécanismes de réparation ont été associées à cette maladie. Cependant, leurs défaillances ne permettent pas à elles seules d’expliquer les symptômes neurologiques et les troubles du développement présents chez plus d’un tiers des personnes atteintes.
D’où l’hypothèse émise par les chercheurs : les différents facteurs impliqués dans la réparation de l’ADN possèderaient d’autres fonctions au-delà du rôle déjà décrit.

…et réguler la transcription

Dans cette nouvelle étude, les chercheurs se sont intéressés au fonctionnement de NER dans des conditions où l’ADN n’est pas soumis à des attaques génotoxiques. Dans ce contexte, les données recueillies par l’équipe de l’IGBMC révèlent que les différents acteurs du complexe NER régulent la transcription des gènes en ARN. Chacun de ces acteurs serait impliqué dans les mécanismes de modification de la chromatine pour rendre le site de départ de la synthèse de l’ARN propice à la transcription. En l’absence de ces facteurs, la transcription sera très peu opérationnelle.

Selon l’endroit précis où se trouve le NER, les fonctions de réparation ou de transcription seront activées. Pour Jean Marc Egly, directeur de recherche à l’Inserm « Cette découverte explique la variété des symptômes observés au niveau du Xeroderma pigmentosum. Elle représente également un grand pas dans la compréhension des mécanismes dits « épigénétiques », qui régulent l’expression des gènes et font en sorte que ces derniers ne s’expriment qu’au bon endroit et au bon moment. »

Mécanisme d'action de NER (Nucleotide excision repair). L'ADN endommagé à la suite d'une attaque par des agents chimiques ou physiques (irradiation UV, etc.) acquiert une forme particulière reconnue par le complexe NER. Lorsque ce dernier se met en marche, il permet d'éliminer et de remplacer le fragment endommagé d'ADN par un fragment sain. © Myriem Belkacem - Inserm

Références :

 
NER factors are recruited to the promoters of activated genes and help chromatin modifications for efficient transcription in the absence of exogenous genotoxic attack
Nicolas Le May,1,3 David Mota-Fernandes,1,3 Renier Vélez-Cruz,1 Izarn Iltis,1 Denis Biard,2 and Jean Marc Egly1

1Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, CNRS/INSERM/ULP, BP 163, 67404 Illkirch Cedex, C. U. Strasbourg, France
2INSERM U602/CEA-IRCM, Hôpital Paul Brousse 12-16 Avenue Paul Vaillant Couturier 94807 Villejuif Cedex, France
3These authors contributed equally to this work

Molecular Cell, April 2010

Source: communiqué de presse du CNRS

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Vue plongeante sur le camp de fouilles à côté de la caverne de Denisova, en Sibérie - AFP

Un type d’hominidé jusque là inconnu ayant vécu voici 40.000 ans en Sibérie a été identifié grâce à un peu d’ADN retrouvé dans un fragment d’os, révélant l’existence d’une lignée disparue d’ancêtres du genre humain, selon une étude publiée mercredi.

Cet hominidé dont un os de la phalange d’un auriculaire a été retrouvé en 2008 dans une caverne à Denisova, dans les Monts Altaï, aurait vécu à la même époque que des hommes de Néanderthal et des hommes modernes.

Il s’agit d’un type d’hominidé jusque-là inconnu, selon Johannes Krause (Institut Max Planck pour l’anthropologie évolutionniste, Leipzig, Allemagne) et ses collègues qui ont analysé un fragment de son ADN issu de mitochondries, les centrales à énergie des cellules.

« Extrêmement surpris » par cette découverte, le directeur du département de génétique de cet institut, Svante Paabo, a estimé lors d’une conférence téléphonique qu’il faut attendre l’analyse du principal génome issu du noyau des cellules, pour déterminer si l’hominidé de Denisova appartient à une nouvelle espèce ou simplement à un lignage différent.

Il faut remonter jusqu’à un million d’années dans le passé pour trouver un ancêtre commun à l’hominidé de Denisova, à l’homme moderne et à Néanderthal dont l’ADN mitochondrial a déjà été analysé, expliquent les chercheurs dans la revue scientifique Nature.

L’hominidé de Denisova ne descendrait pas du premier groupe hominidé, appartenant à l’espèce Homo erectus, qui avait quitté l’Afrique voici 1,9 million d’années, soit 900.000 ans avant l’apparition supposée de cet ancêtre commun avec l’homme moderne (Homo sapiens) et celui de Néanderthal.

Il serait issu d’une migration de représentants du genre Homo hors du continent africain différente de celles effectuées par les ancêtres de Néanderthal, il y a 300.000 à 500.000 ans, et les hommes modernes, il y a 50.000 ans.

Jusqu’à récemment, on supposait que les seuls représentants du genre humain vivant il y a 40.000 ans étaient les hommes de Néanderthal et les Homo sapiens.

La découverte en 2003 en Indonésie du petit homme de Flores, dont le plus récent fossile date de 13.000 ans, a fait supposer l’existence d’une troisième espèce humaine.

L’hominidé de Denisova qui pourrait représenter une quatrième espèce éteinte, « oblige à revoir l’histoire de la récente occupation humaine en Eurasie », souligne un expert britannique Terence Brown dans un commentaire publié dans Nature.

Cet hominidé aurait vécu voici 30.000 ans à 48.000 ans, d’après la datation d’échantillons du sol de la grotte où des fragments de son squelette ont été trouvés.

Il aurait pu, selon les chercheurs, côtoyer des hommes de Néanderthal qui, à la même époque, étaient « présents à moins de 100 km de la grotte Denisova dans les Monts Altaï » et des hommes modernes qui ont vécu dans l’Altaï depuis plus de 40.000 ans.

Source: © 2010 AFP

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molécule d’acide ribonucléique - source: Wikipedia

 
Découvert à la fin des années 90, le mécanisme qui permet de réduire des gènes au silence est devenu un incontournable outil de laboratoire, notamment pour étudier les fonctions des différents gènes d’un organisme, végétal ou animal. Grâce à l’ARN interférent (ARNi), c’est le nom de cette molécule d’acide ribonucléique, on projette aussi de s’attaquer à des maladies en bloquant des gènes et en empêchant la fabrication de protéines néfastes.

Pour la première fois, une équipe a montré que ce mécanisme fonctionnait chez l’être humain, contre des cellules cancéreuses.

Les résultats obtenus en laboratoire avec l’ARNi sont probants mais passer à l’application clinique est complexe. Il faut pouvoir acheminer les ARN interférents jusqu’à la cible. L’équipe de Mark Davis (Caltech, Pasadena, États-Unis) a créé des nanoparticules, composées de deux polymères et d’une protéine, qui sont injectées dans le sang des patients et qui véhiculent un ARN interférent spécialement conçu pour s’attaquer à un gène des cellules de mélanome malin.

Des biopsies ont été pratiquées sur trois des quinze patients qui participent à cet essai clinique pionnier aux États-Unis. Les analyses des cellules de mélanomes ont révélé que les nanoparticules ont bien atteint les cellules cibles et que plus la dose injectée était élevée, plus la quantité de petits ARNi présents dans le mélanome était importante.

Second élément crucial: les ARNi ont fait le travail que l’on attendait d’eux, rapportent Davis et ses collègues aujourd’hui dans la revue Nature (AOP). Ces petits ARN double brin s’attaque à un autre ARN, dit messager, qui transporte les instructions indispensables à la cellule pour fabriquer une protéine à partir du code contenu par l’ADN. Les chercheurs ont justement retrouvé des fragments d’ARN messagers qui étaient coupés à l’endroit visé par l’ARN interférent.

Cette première étape clinique, conçue pour étudier la sécurité du traitement, montre pour la première fois que l’utilisation de l’ARNi est possible chez l’humain. Il faut encore établir que ce mode de traitement est efficace pour combattre le cancer et confirmer qu’il n’a pas d’effets secondaires indésirables.

Ces travaux ouvrent de nouvelles perspectives de lutte contre des protéines que les médicaments ne parviennent pas à neutraliser, faute d’un récepteur facile à cibler par exemple. En s’attaquant en amont à leur fabrication, l’ARN interférent offre une arme exceptionnelle.

Source: Cécile Dumas – Sciences-et-Avenir.fr

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Des scientifiques australiens ont annoncé mercredi avoir extrait de l'ADN de coquilles d'oeufs fossilisées d'espèces éteintes d'oiseaux, y compris le géant moa et l'oiseau-éléphant. © 2010 AFP (Shaun Curry)

Des scientifiques australiens ont annoncé mercredi avoir extrait de l’ADN de coquilles d’oeufs fossilisées d’espèces éteintes d’oiseaux, y compris le géant moa et l’oiseau-éléphant.

« Nous montrons pour la première fois que les coquilles d’oeufs fossilisées sont une source jusque-là méconnue d’ADN ancien », expliquent Michael Bunce (Murdoch University, Perth, Australie) et ses collègues.

Ils ont réussi pour la première fois à obtenir des séquences d’ADN du plus lourd oiseau ayant existé, l’oiseau-éléphant (Aepyornis), disparu de Madagascar vers 1700 à la suite de la colonisation européenne, selon l’étude publiée mercredi dans la revue scientifique britannique Proceedings of the Royal Society B.

Les oeufs fossilisés ont été largement utilisés pour reconstruire l’écologie, l’alimentation passée, voire pour retracer une chronologie. Mais c’est seulement récemment que de l’ADN a pu en être extrait, rappellent ces chercheurs.

Pour examiner dans quelle mesure l’ADN est préservé dans les coquilles fossiles, l’équipe de Michael Bunce a analysé 18 fragments d’oeufs fossilisés provenant de 13 sites en Australie, à Madagascar et en Nouvelle Zélande.

« Nos données démontrent l’excellente préservation des acides nucléiques » (les composants de l’ADN) provenant, pour de nombreux échantillons, à la fois de l’ADN mitochondrial (spécifique aux centrales à énergie des cellules) et du principal ADN blotti au coeur du noyau des cellules, concluent les chercheurs.

Le matériel génétique extrait de coquilles d’oeufs de moa (Dinornis), un cousin de l’autruche ayant atteint quatre mètres de hauteur, s’est révélé de meilleure qualité que celui provenant d’os. Les « coquilles d’oeufs de moa contiennent approximativement 125 fois moins » de bactéries que les os, ce qui en fait un matériau très adapté pour des analyses génétiques, soulignent les chercheurs.

L’oiseau géant moa, chassé par les Maori de Nouvelle-Zélande, a disparu à la fin du XVIIIe siècle.

Les chercheurs ont réussi pour la première fois à obtenir des séquences d'ADN du plus lourd oiseau ayant existé, l'oiseau-éléphant (Aepyornis), disparu de Madagascar vers 1700 à la suite de la colonisation européenne. © 2010 AFP (Irène Delui)

Pour les chercheurs, il n’est pas question de ressusciter les espèces éteintes comme le moa et l’oiseau-éléphant.

« Nous pouvons réassembler le génome pour avoir une idée d’à quoi ressemblait une espèce éteinte. Mais (la ressusciter) reste du domaine de la science-fiction », a précisé M. Bunce à l’AFP. « Je pense qu’il ne serait pas éthique de recréer une espèce éteinte », a ajouté sa collègue Charlotte Oskam.

Les chercheurs, qui tentaient seulement de valider la technique utilisée, n’ont d’ailleurs extrait qu’une infime partie (moins de 1%) de l’ADN du moa, de l’oiseau-éléphant ou d’un émeu (Dromaius novaehollandiae) datant de 19.000 ans, le plus vieil oeuf fossile dont ils ont réussi à tirer du matériel génétique.

Source : AOL

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Structure ADN

« Ce que suggère notre étude, c’est que certaines personnes sont génétiquement programmées pour vieillir plus vite », a indiqué un des chercheurs du King’s College de Londres, Tim Spector.

Menée par une équipe du King’s College et de l’université de Leicester, cette étude a été publiée dimanche dans Nature Genetics.

Les chercheurs font la distinction entre deux types de vieillissement, le premier « chronologique », lié à l’âge d’un individu, et le second « biologique », lié au vieillissement de ses cellules.

L’horloge qui contrôle le vieillissement des cellules est le raccourcissement des télomères, des structures d’ADN situées à l’extrémité des chromosomes.

« Les individus naissent avec des télomères d’une certaine longueur, et dans de nombreuses cellules, les télomères raccourcissent lorsque les cellules se divisent et vieillissent », a expliqué le professeur de cardiologie Nilesh Samani (université de Leicester). « La longueur des télomères est de ce fait considérée comme un marqueur de l’âge biologique ».

« Nous avons trouvé que les individus porteurs d’une variation génétique particulière ont des télomères plus courts, c’est-à-dire qu’ils apparaissent biologiquement plus vieux », a indiqué le Pr Samani.

Les variants identifiés se situent près d’un gène dénommé TERC, « déjà connu pour jouer un rôle important dans le maintien de la longueur des télomères », a précisé le Pr Spector.

Les chercheurs ont analysé plus de 500.000 variations génétiques dans le génome humain pour identifier les variants localisés près du gène TERC. L’effet de ces variants, chez les individus porteurs, serait équivalent à 3 ou 4 années d’âge biologique, selon les chercheurs.

« D’un autre côté, des personnes présentant une susceptibilité génétique peuvent vieillir encore plus vite si elles sont exposées à un mauvais environnement pour les télomères, comme le tabagisme, l’obésité ou la sédentarité », a déclaré le Pr Spector.

« Il y a un faisceau de preuves montrant que le risque de maladies liées à l’âge, incluant les maladies cardiaques et certains types de cancers, sont plus étroitement associées à l’âge biologique qu’à l’âge chronologique », a pour sa part affirmé le Pr Samani.

Source : AFP

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